ACSUCYL realiza la evaluación de las solicitudes recibidas a través de la Comisión de Evaluación de la Calidad Institucional, que es el órgano coordinador del proceso y por tanto el encargado de:
La Comisión de Evaluación de la Calidad Institucional contará con el apoyo de un grupo de expertos que realizará la evaluación inicial de las solicitudes recibidas. Dicho grupo estará formado por expertos de reconocida competencia en el ámbito académico o empresarial y ajenos a las universidades de Castilla y León. Llevarán a cabo la evaluación de las solicitudes presentadas y emitirán un informe de evaluación por cada una de las Cátedras que elevará a la Comisión de Evaluación de la Calidad Institucional quién emitirá un informe final colegiado por cada solicitud.
Como estipula el Código Ético de la Agencia, los miembros de los órganos de evaluación han de abstenerse de evaluar las solicitudes en las que participen directamente o en las que pueda producirse conflicto de intereses.