ACSUCYL evalúa las solicitudes presentadas en estos procesos a través de los siguientes órganos de evaluación: 

Comisión de Evaluación de la Investigación

La Comisión de Evaluación de la Investigación es el órgano responsable de coordinar el proceso y de emitir los Informes Finales. Esta Comisión supervisa la adecuada aplicación de los criterios de evaluación por parte de los Paneles Científicos.

En ambos procesos, la Comisión podrá convocar a una entrevista bien al promotor/es del Instituto, bien a su Director, como se indica en el procedimiento de evaluación. 

Paneles Científicos

En la primera fase del proceso, las solicitudes son evaluadas individualmente por un panel de dos expertos, vinculados a alguna de las áreas de conocimiento del Instituto correspondiente, y ajenos a las Universidades de Castilla y León.

Este Panel, en el procedimiento de evaluación periódica, realizará una visita al Instituto evaluado, con el objeto de celebrar audiencias con los distintos colectivos del centro. El Panel será presidido por un miembro de la Comisión, formarán parte del mismo al menos dos expertos en alguna de las áreas de conocimiento del Instituto correspondiente, y contará con el apoyo de un Técnico de ACSUCYL.

Como estipula el Código Ético de la Agencia, los miembros de los órganos de evaluación han de abstenerse de evaluar las solicitudes en las que participen directamente o en las que pueda producirse conflicto de intereses.