ACSUCYL realiza la evaluación expost de los proyectos y programas de investigación a través de los siguientes órganos de evaluación:

Comisión de Evaluación de la Investigación

La Comisión de Evaluación de la Investigación es el órgano responsable de coordinar el proceso y de emitir los informes finales de evaluación. Esta Comisión supervisa la adecuada aplicación de los criterios de evaluación por parte de los Paneles Científicos y los Coordinadores de Área.

Coordinadores de Área

Los Coordinadores de Área, expertos ajenos a las Universidades de Castilla y León, son los responsables de elaborar la propuesta de informe de evaluación expost de los proyectos a partir de los informes de evaluación emitidos por los Paneles Científicos. Su número puede ser variable, pero, como referencia, se establece un Coordinador por cada una de las áreas de evaluación que la ANEP tiene definidas. 

Paneles Científicos

En la primera fase del proceso, los proyectos son evaluados individualmente por un panel de al menos dos expertos en el tema del proyecto o vinculados a alguna de las áreas de conocimiento del mismo, ajenos a las Universidades de Castilla y León.

Los Coordinadores de Área no elaboran las propuestas de informes de evaluación cuando en los informes del Panel Científico existe un alto grado de coincidencia en la valoración que realicen de los proyectos o programas, en estos es la CEI quien realiza directamente los informes finales.

Como estipula el Código Ético de la Agencia, los miembros de los órganos de evaluación han de abstenerse de evaluar las solicitudes en las que participen directamente o en las que pueda producirse conflicto de intereses.